Protein–RNA interactions for Protein: P26043

Rdx, Radixin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RdxP26043 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RdxP26043 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RdxP26043 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RdxP26043 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RdxP26043 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RdxP26043 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RdxP26043 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RdxP26043 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RdxP26043 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RdxP26043 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RdxP26043 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RdxP26043 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RdxP26043 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RdxP26043 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RdxP26043 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RdxP26043 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RdxP26043 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RdxP26043 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RdxP26043 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RdxP26043 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RdxP26043 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RdxP26043 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RdxP26043 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RdxP26043 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RdxP26043 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RdxP26043 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RdxP26043 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RdxP26043 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RdxP26043 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RdxP26043 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RdxP26043 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RdxP26043 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RdxP26043 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RdxP26043 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RdxP26043 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RdxP26043 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RdxP26043 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RdxP26043 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RdxP26043 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RdxP26043 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RdxP26043 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RdxP26043 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RdxP26043 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RdxP26043 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RdxP26043 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RdxP26043 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RdxP26043 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RdxP26043 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RdxP26043 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RdxP26043 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RdxP26043 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RdxP26043 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RdxP26043 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RdxP26043 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RdxP26043 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RdxP26043 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RdxP26043 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RdxP26043 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RdxP26043 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RdxP26043 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RdxP26043 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RdxP26043 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RdxP26043 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RdxP26043 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RdxP26043 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RdxP26043 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RdxP26043 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RdxP26043 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RdxP26043 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RdxP26043 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RdxP26043 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RdxP26043 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RdxP26043 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RdxP26043 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RdxP26043 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RdxP26043 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RdxP26043 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RdxP26043 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RdxP26043 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RdxP26043 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RdxP26043 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RdxP26043 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RdxP26043 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RdxP26043 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RdxP26043 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RdxP26043 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RdxP26043 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RdxP26043 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RdxP26043 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RdxP26043 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RdxP26043 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RdxP26043 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RdxP26043 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RdxP26043 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
RdxP26043 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RdxP26043 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RdxP26043 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RdxP26043 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RdxP26043 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RdxP26043 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms