Protein–RNA interactions for Protein: P21278

Gna11, Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gna11P21278 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gna11P21278 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gna11P21278 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gna11P21278 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gna11P21278 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gna11P21278 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gna11P21278 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gna11P21278 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gna11P21278 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gna11P21278 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gna11P21278 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gna11P21278 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gna11P21278 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms