Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TP20293 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TP20293 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TP20293 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TP20293 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TP20293 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TP20293 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TP20293 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TP20293 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TP20293 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TP20293 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TP20293 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TP20293 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TP20293 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TP20293 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TP20293 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TP20293 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TP20293 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TP20293 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TP20293 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TP20293 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TP20293 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TP20293 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TP20293 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TP20293 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TP20293 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TP20293 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TP20293 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TP20293 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TP20293 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TP20293 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TP20293 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TP20293 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TP20293 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TP20293 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TP20293 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TP20293 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TP20293 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TP20293 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TP20293 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TP20293 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TP20293 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TP20293 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TP20293 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TP20293 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TP20293 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TP20293 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TP20293 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TP20293 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TP20293 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TP20293 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TP20293 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TP20293 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TP20293 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TP20293 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TP20293 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TP20293 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TP20293 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TP20293 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TP20293 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TP20293 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TP20293 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TP20293 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TP20293 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TP20293 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TP20293 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TP20293 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TP20293 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TP20293 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TP20293 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TP20293 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TP20293 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TP20293 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TP20293 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TP20293 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TP20293 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TP20293 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TP20293 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TP20293 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TP20293 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TP20293 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TP20293 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TP20293 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TP20293 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TP20293 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TP20293 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TP20293 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TP20293 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TP20293 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TP20293 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TP20293 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TP20293 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TP20293 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TP20293 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TP20293 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TP20293 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TP20293 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TP20293 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TP20293 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
TP20293 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms