Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou5f1P20263 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms