Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
P20040 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
P20040 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
P20040 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
P20040 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
P20040 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
P20040 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
P20040 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
P20040 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
P20040 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
P20040 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
P20040 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
P20040 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
P20040 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
P20040 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
P20040 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
P20040 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
P20040 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
P20040 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
P20040 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
P20040 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
P20040 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
P20040 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
P20040 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
P20040 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
P20040 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
P20040 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
P20040 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
P20040 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
P20040 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
P20040 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
P20040 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
P20040 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
P20040 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
P20040 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
P20040 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
P20040 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
P20040 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
P20040 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
P20040 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
P20040 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
P20040 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
P20040 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
P20040 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
P20040 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
P20040 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
P20040 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
P20040 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
P20040 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
P20040 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
P20040 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
P20040 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
P20040 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
P20040 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
P20040 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
P20040 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
P20040 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
P20040 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
P20040 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
P20040 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
P20040 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
P20040 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
P20040 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
P20040 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
P20040 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
P20040 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
P20040 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
P20040 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
P20040 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
P20040 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
P20040 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
P20040 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
P20040 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
P20040 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
P20040 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
P20040 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
P20040 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
P20040 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
P20040 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
P20040 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
P20040 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
P20040 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
P20040 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
P20040 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
P20040 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
P20040 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
P20040 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
P20040 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
P20040 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
P20040 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
P20040 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
P20040 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
P20040 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
P20040 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
P20040 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
P20040 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
P20040 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
P20040 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
P20040 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
P20040 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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