Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfaP20033 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms