Protein–RNA interactions for Protein: P19785

Esr1, Estrogen receptor, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Esr1P19785 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Esr1P19785 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Esr1P19785 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Esr1P19785 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Esr1P19785 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Esr1P19785 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Esr1P19785 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Esr1P19785 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Esr1P19785 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms