Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms