Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
P18533 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P18533 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P18533 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P18533 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P18533 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P18533 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P18533 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P18533 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
P18533 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
P18533 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P18533 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P18533 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P18533 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
P18533 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P18533 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P18533 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P18533 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
P18533 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P18533 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P18533 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P18533 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P18533 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P18533 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P18533 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P18533 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
P18533 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
P18533 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P18533 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P18533 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P18533 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15□□□□□ -0.01
P18533 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
P18533 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
P18533 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P18533 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
P18533 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P18533 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P18533 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
P18533 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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P18533 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P18533 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P18533 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P18533 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
P18533 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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P18533 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P18533 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P18533 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P18533 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P18533 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P18533 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P18533 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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P18533 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P18533 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P18533 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P18533 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P18533 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P18533 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P18533 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P18533 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P18533 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P18533 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P18533 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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P18533 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P18533 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P18533 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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P18533 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P18533 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P18533 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P18533 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P18533 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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P18533 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P18533 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P18533 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P18533 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P18533 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P18533 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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