Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtpraP18052 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtpraP18052 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PtpraP18052 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtpraP18052 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtpraP18052 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtpraP18052 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtpraP18052 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PtpraP18052 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms