Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms