Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms