Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Calb1P12658 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Calb1P12658 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Calb1P12658 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Calb1P12658 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Calb1P12658 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Calb1P12658 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Calb1P12658 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms