Protein–RNA interactions for Protein: P11679

Krt8, Keratin, type II cytoskeletal 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt8P11679 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt8P11679 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt8P11679 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt8P11679 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt8P11679 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt8P11679 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms