Protein–RNA interactions for Protein: P11378

Tnp2, Nuclear transition protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp2P11378 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tnp2P11378 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tnp2P11378 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tnp2P11378 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tnp2P11378 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tnp2P11378 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tnp2P11378 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tnp2P11378 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tnp2P11378 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tnp2P11378 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tnp2P11378 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tnp2P11378 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tnp2P11378 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Tnp2P11378 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Tnp2P11378 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tnp2P11378 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms