Protein–RNA interactions for Protein: P10923

Spp1, Osteopontin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spp1P10923 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spp1P10923 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spp1P10923 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spp1P10923 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spp1P10923 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spp1P10923 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spp1P10923 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms