Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PolP10400 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PolP10400 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PolP10400 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PolP10400 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PolP10400 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PolP10400 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PolP10400 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PolP10400 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PolP10400 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PolP10400 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PolP10400 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PolP10400 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PolP10400 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PolP10400 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PolP10400 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PolP10400 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PolP10400 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PolP10400 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PolP10400 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PolP10400 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PolP10400 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PolP10400 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PolP10400 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PolP10400 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PolP10400 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PolP10400 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PolP10400 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PolP10400 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PolP10400 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PolP10400 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PolP10400 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PolP10400 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PolP10400 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PolP10400 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PolP10400 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PolP10400 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PolP10400 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PolP10400 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PolP10400 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PolP10400 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PolP10400 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PolP10400 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PolP10400 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PolP10400 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PolP10400 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PolP10400 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PolP10400 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PolP10400 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PolP10400 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PolP10400 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PolP10400 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PolP10400 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PolP10400 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PolP10400 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PolP10400 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PolP10400 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PolP10400 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PolP10400 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PolP10400 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PolP10400 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PolP10400 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PolP10400 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PolP10400 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PolP10400 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PolP10400 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PolP10400 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PolP10400 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PolP10400 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PolP10400 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PolP10400 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PolP10400 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PolP10400 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PolP10400 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PolP10400 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PolP10400 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PolP10400 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PolP10400 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PolP10400 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PolP10400 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PolP10400 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PolP10400 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PolP10400 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PolP10400 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PolP10400 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PolP10400 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PolP10400 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PolP10400 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PolP10400 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PolP10400 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PolP10400 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PolP10400 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PolP10400 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PolP10400 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PolP10400 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PolP10400 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PolP10400 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PolP10400 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PolP10400 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PolP10400 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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