Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms