Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms