Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms