Protein–RNA interactions for Protein: P0C5K0

Sbk3, Uncharacterized serine/threonine-protein kinase SBK3, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbk3P0C5K0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sbk3P0C5K0 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sbk3P0C5K0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sbk3P0C5K0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sbk3P0C5K0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sbk3P0C5K0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sbk3P0C5K0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sbk3P0C5K0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms