Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Surf1P09925 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Surf1P09925 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Surf1P09925 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Surf1P09925 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Surf1P09925 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf1P09925 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms