Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NefmP08553 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NefmP08553 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NefmP08553 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NefmP08553 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NefmP08553 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NefmP08553 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NefmP08553 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NefmP08553 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NefmP08553 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NefmP08553 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NefmP08553 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NefmP08553 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NefmP08553 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NefmP08553 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NefmP08553 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NefmP08553 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NefmP08553 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NefmP08553 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NefmP08553 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NefmP08553 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NefmP08553 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NefmP08553 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NefmP08553 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NefmP08553 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NefmP08553 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NefmP08553 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NefmP08553 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NefmP08553 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NefmP08553 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NefmP08553 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NefmP08553 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NefmP08553 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NefmP08553 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NefmP08553 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NefmP08553 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NefmP08553 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NefmP08553 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NefmP08553 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NefmP08553 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NefmP08553 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NefmP08553 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NefmP08553 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NefmP08553 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NefmP08553 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NefmP08553 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NefmP08553 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NefmP08553 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NefmP08553 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NefmP08553 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NefmP08553 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NefmP08553 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NefmP08553 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NefmP08553 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NefmP08553 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NefmP08553 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NefmP08553 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NefmP08553 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NefmP08553 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NefmP08553 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NefmP08553 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NefmP08553 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NefmP08553 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NefmP08553 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NefmP08553 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NefmP08553 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NefmP08553 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NefmP08553 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NefmP08553 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NefmP08553 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NefmP08553 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NefmP08553 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NefmP08553 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NefmP08553 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NefmP08553 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NefmP08553 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NefmP08553 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NefmP08553 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NefmP08553 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NefmP08553 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NefmP08553 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NefmP08553 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NefmP08553 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NefmP08553 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NefmP08553 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NefmP08553 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NefmP08553 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NefmP08553 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NefmP08553 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NefmP08553 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NefmP08553 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NefmP08553 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NefmP08553 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NefmP08553 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NefmP08553 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NefmP08553 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NefmP08553 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NefmP08553 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NefmP08553 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NefmP08553 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms