Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

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Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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