Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Spta1P08032 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spta1P08032 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Spta1P08032 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spta1P08032 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spta1P08032 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spta1P08032 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spta1P08032 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spta1P08032 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spta1P08032 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Spta1P08032 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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