Protein–RNA interactions for Protein: P06336

Ig epsilon chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06336 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06336 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06336 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06336 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06336 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06336 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06336 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06336 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06336 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
P06336 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06336 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06336 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06336 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06336 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06336 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06336 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06336 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06336 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06336 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06336 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06336 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06336 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06336 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06336 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06336 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06336 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06336 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06336 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
P06336 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
P06336 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06336 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
P06336 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06336 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06336 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06336 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06336 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06336 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06336 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06336 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06336 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06336 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06336 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06336 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06336 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06336 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06336 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06336 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06336 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06336 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06336 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06336 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06336 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06336 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06336 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06336 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06336 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06336 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06336 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06336 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06336 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06336 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06336 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06336 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06336 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06336 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06336 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06336 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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P06336 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06336 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06336 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06336 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06336 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P06336 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06336 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06336 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06336 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06336 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06336 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06336 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06336 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06336 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06336 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06336 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06336 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06336 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06336 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06336 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06336 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06336 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06336 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06336 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06336 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06336 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06336 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06336 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06336 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06336 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06336 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06336 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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