Protein–RNA interactions for Protein: P01810

Ig heavy chain V region J539, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01810 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01810 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01810 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01810 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01810 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01810 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01810 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01810 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01810 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01810 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01810 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01810 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01810 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01810 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01810 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01810 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01810 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01810 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01810 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01810 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01810 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01810 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01810 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01810 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01810 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01810 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01810 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01810 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01810 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01810 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01810 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01810 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01810 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01810 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01810 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01810 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01810 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01810 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01810 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01810 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01810 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01810 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01810 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01810 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01810 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01810 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01810 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01810 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01810 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01810 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01810 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01810 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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P01810 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01810 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01810 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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P01810 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01810 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01810 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01810 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01810 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01810 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01810 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01810 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01810 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01810 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01810 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01810 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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P01810 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01810 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01810 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01810 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01810 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01810 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01810 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01810 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01810 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01810 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01810 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01810 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01810 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01810 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01810 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01810 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01810 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01810 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01810 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01810 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01810 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01810 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01810 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01810 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01810 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01810 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01810 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01810 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01810 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms