Protein–RNA interactions for Protein: O89104

Sypl2, Synaptophysin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl2O89104 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sypl2O89104 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sypl2O89104 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sypl2O89104 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sypl2O89104 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sypl2O89104 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sypl2O89104 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sypl2O89104 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sypl2O89104 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sypl2O89104 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sypl2O89104 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sypl2O89104 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sypl2O89104 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sypl2O89104 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sypl2O89104 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sypl2O89104 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sypl2O89104 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sypl2O89104 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sypl2O89104 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sypl2O89104 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sypl2O89104 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sypl2O89104 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sypl2O89104 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sypl2O89104 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sypl2O89104 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sypl2O89104 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sypl2O89104 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sypl2O89104 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sypl2O89104 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sypl2O89104 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sypl2O89104 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sypl2O89104 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sypl2O89104 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sypl2O89104 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sypl2O89104 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sypl2O89104 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sypl2O89104 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sypl2O89104 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sypl2O89104 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms