Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
F11rO88792 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
F11rO88792 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
F11rO88792 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
F11rO88792 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
F11rO88792 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
F11rO88792 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
F11rO88792 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
F11rO88792 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
F11rO88792 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
F11rO88792 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
F11rO88792 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
F11rO88792 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
F11rO88792 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
F11rO88792 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
F11rO88792 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
F11rO88792 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
F11rO88792 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
F11rO88792 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
F11rO88792 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
F11rO88792 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
F11rO88792 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
F11rO88792 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
F11rO88792 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
F11rO88792 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
F11rO88792 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
F11rO88792 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
F11rO88792 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
F11rO88792 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
F11rO88792 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
F11rO88792 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
F11rO88792 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
F11rO88792 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
F11rO88792 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
F11rO88792 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
F11rO88792 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
F11rO88792 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
F11rO88792 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
F11rO88792 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
F11rO88792 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
F11rO88792 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
F11rO88792 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
F11rO88792 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
F11rO88792 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
F11rO88792 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
F11rO88792 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
F11rO88792 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
F11rO88792 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
F11rO88792 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
F11rO88792 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
F11rO88792 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
F11rO88792 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
F11rO88792 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
F11rO88792 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
F11rO88792 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
F11rO88792 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
F11rO88792 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
F11rO88792 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
F11rO88792 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
F11rO88792 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
F11rO88792 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
F11rO88792 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
F11rO88792 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
F11rO88792 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
F11rO88792 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
F11rO88792 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
F11rO88792 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
F11rO88792 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
F11rO88792 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
F11rO88792 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
F11rO88792 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
F11rO88792 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
F11rO88792 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
F11rO88792 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
F11rO88792 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
F11rO88792 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
F11rO88792 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
F11rO88792 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
F11rO88792 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
F11rO88792 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
F11rO88792 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
F11rO88792 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
F11rO88792 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
F11rO88792 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
F11rO88792 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
F11rO88792 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
F11rO88792 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
F11rO88792 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
F11rO88792 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
F11rO88792 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
F11rO88792 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
F11rO88792 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
F11rO88792 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
F11rO88792 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
F11rO88792 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
F11rO88792 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
F11rO88792 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
F11rO88792 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
F11rO88792 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
F11rO88792 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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