Protein–RNA interactions for Protein: O88454

Kcnk4, Potassium channel subfamily K member 4, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk4O88454 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnk4O88454 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnk4O88454 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnk4O88454 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnk4O88454 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnk4O88454 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnk4O88454 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnk4O88454 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnk4O88454 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnk4O88454 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnk4O88454 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnk4O88454 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnk4O88454 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnk4O88454 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnk4O88454 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnk4O88454 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnk4O88454 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnk4O88454 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnk4O88454 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnk4O88454 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnk4O88454 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnk4O88454 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnk4O88454 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnk4O88454 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnk4O88454 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnk4O88454 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnk4O88454 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnk4O88454 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnk4O88454 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnk4O88454 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnk4O88454 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnk4O88454 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnk4O88454 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnk4O88454 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnk4O88454 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnk4O88454 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnk4O88454 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnk4O88454 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms