Protein–RNA interactions for Protein: O70456

Sfn, 14-3-3 protein sigma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfnO70456 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SfnO70456 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SfnO70456 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SfnO70456 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SfnO70456 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SfnO70456 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SfnO70456 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SfnO70456 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SfnO70456 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SfnO70456 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SfnO70456 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SfnO70456 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SfnO70456 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SfnO70456 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SfnO70456 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SfnO70456 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SfnO70456 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SfnO70456 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SfnO70456 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SfnO70456 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SfnO70456 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SfnO70456 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SfnO70456 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SfnO70456 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SfnO70456 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SfnO70456 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SfnO70456 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SfnO70456 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SfnO70456 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SfnO70456 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SfnO70456 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SfnO70456 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SfnO70456 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SfnO70456 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SfnO70456 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SfnO70456 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SfnO70456 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SfnO70456 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SfnO70456 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SfnO70456 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SfnO70456 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SfnO70456 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SfnO70456 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SfnO70456 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SfnO70456 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SfnO70456 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SfnO70456 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SfnO70456 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SfnO70456 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SfnO70456 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SfnO70456 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SfnO70456 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SfnO70456 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SfnO70456 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SfnO70456 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SfnO70456 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SfnO70456 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SfnO70456 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SfnO70456 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SfnO70456 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SfnO70456 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SfnO70456 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SfnO70456 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SfnO70456 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SfnO70456 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SfnO70456 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SfnO70456 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SfnO70456 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SfnO70456 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SfnO70456 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SfnO70456 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SfnO70456 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SfnO70456 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SfnO70456 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SfnO70456 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SfnO70456 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SfnO70456 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SfnO70456 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SfnO70456 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SfnO70456 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SfnO70456 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SfnO70456 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SfnO70456 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SfnO70456 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SfnO70456 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SfnO70456 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SfnO70456 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SfnO70456 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SfnO70456 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SfnO70456 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SfnO70456 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SfnO70456 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SfnO70456 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SfnO70456 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SfnO70456 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SfnO70456 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SfnO70456 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SfnO70456 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SfnO70456 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SfnO70456 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms