Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lnx1O70263 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lnx1O70263 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lnx1O70263 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lnx1O70263 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lnx1O70263 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lnx1O70263 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lnx1O70263 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lnx1O70263 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lnx1O70263 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lnx1O70263 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lnx1O70263 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lnx1O70263 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lnx1O70263 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lnx1O70263 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lnx1O70263 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lnx1O70263 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lnx1O70263 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lnx1O70263 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lnx1O70263 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lnx1O70263 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lnx1O70263 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lnx1O70263 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lnx1O70263 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lnx1O70263 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lnx1O70263 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lnx1O70263 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lnx1O70263 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lnx1O70263 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lnx1O70263 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lnx1O70263 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lnx1O70263 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lnx1O70263 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lnx1O70263 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lnx1O70263 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lnx1O70263 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lnx1O70263 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lnx1O70263 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
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