Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms