Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms