Protein–RNA interactions for Protein: O35493

Clk4, Dual specificity protein kinase CLK4, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk4O35493 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk4O35493 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk4O35493 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk4O35493 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk4O35493 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk4O35493 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk4O35493 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk4O35493 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk4O35493 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk4O35493 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk4O35493 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk4O35493 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk4O35493 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk4O35493 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk4O35493 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk4O35493 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk4O35493 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk4O35493 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk4O35493 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk4O35493 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk4O35493 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk4O35493 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk4O35493 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk4O35493 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk4O35493 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk4O35493 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk4O35493 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk4O35493 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk4O35493 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk4O35493 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk4O35493 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk4O35493 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk4O35493 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk4O35493 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk4O35493 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk4O35493 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clk4O35493 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clk4O35493 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clk4O35493 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Clk4O35493 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clk4O35493 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clk4O35493 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clk4O35493 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clk4O35493 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clk4O35493 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk4O35493 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk4O35493 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk4O35493 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk4O35493 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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