Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms