Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms