Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms