Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

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Length 495 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad6O35182 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad6O35182 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad6O35182 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad6O35182 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad6O35182 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms