Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Scarb2O35114 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Scarb2O35114 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scarb2O35114 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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