Protein–RNA interactions for Protein: O09117

Sypl1, Synaptophysin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl1O09117 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms