Protein–RNA interactions for Protein: O08785

Clock, Circadian locomoter output cycles protein kaput, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClockO08785 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClockO08785 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClockO08785 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ClockO08785 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClockO08785 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClockO08785 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ClockO08785 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClockO08785 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClockO08785 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClockO08785 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClockO08785 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClockO08785 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClockO08785 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClockO08785 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClockO08785 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClockO08785 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ClockO08785 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClockO08785 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClockO08785 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClockO08785 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClockO08785 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClockO08785 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ClockO08785 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ClockO08785 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ClockO08785 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ClockO08785 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ClockO08785 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ClockO08785 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ClockO08785 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ClockO08785 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClockO08785 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClockO08785 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClockO08785 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClockO08785 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ClockO08785 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClockO08785 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClockO08785 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClockO08785 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClockO08785 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClockO08785 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClockO08785 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClockO08785 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClockO08785 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClockO08785 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClockO08785 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClockO08785 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClockO08785 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClockO08785 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClockO08785 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClockO08785 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ClockO08785 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClockO08785 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClockO08785 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClockO08785 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClockO08785 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClockO08785 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClockO08785 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClockO08785 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClockO08785 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClockO08785 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClockO08785 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClockO08785 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClockO08785 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClockO08785 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClockO08785 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClockO08785 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClockO08785 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClockO08785 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClockO08785 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClockO08785 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClockO08785 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClockO08785 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClockO08785 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClockO08785 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClockO08785 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClockO08785 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClockO08785 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClockO08785 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClockO08785 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClockO08785 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClockO08785 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClockO08785 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClockO08785 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClockO08785 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClockO08785 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClockO08785 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClockO08785 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClockO08785 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClockO08785 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClockO08785 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClockO08785 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClockO08785 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClockO08785 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClockO08785 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ClockO08785 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClockO08785 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClockO08785 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClockO08785 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClockO08785 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClockO08785 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms