Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MttpO08601 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MttpO08601 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MttpO08601 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MttpO08601 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MttpO08601 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MttpO08601 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MttpO08601 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MttpO08601 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MttpO08601 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MttpO08601 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MttpO08601 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MttpO08601 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MttpO08601 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MttpO08601 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MttpO08601 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MttpO08601 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MttpO08601 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MttpO08601 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MttpO08601 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MttpO08601 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MttpO08601 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MttpO08601 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MttpO08601 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MttpO08601 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MttpO08601 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MttpO08601 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MttpO08601 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MttpO08601 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MttpO08601 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MttpO08601 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MttpO08601 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MttpO08601 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MttpO08601 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MttpO08601 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MttpO08601 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MttpO08601 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MttpO08601 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MttpO08601 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MttpO08601 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MttpO08601 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MttpO08601 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MttpO08601 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MttpO08601 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MttpO08601 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MttpO08601 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MttpO08601 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MttpO08601 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MttpO08601 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MttpO08601 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MttpO08601 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MttpO08601 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MttpO08601 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MttpO08601 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MttpO08601 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MttpO08601 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MttpO08601 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MttpO08601 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MttpO08601 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MttpO08601 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MttpO08601 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MttpO08601 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MttpO08601 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MttpO08601 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MttpO08601 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MttpO08601 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MttpO08601 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MttpO08601 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MttpO08601 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MttpO08601 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MttpO08601 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MttpO08601 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MttpO08601 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MttpO08601 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MttpO08601 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MttpO08601 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MttpO08601 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MttpO08601 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MttpO08601 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MttpO08601 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MttpO08601 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MttpO08601 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MttpO08601 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MttpO08601 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MttpO08601 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MttpO08601 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MttpO08601 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MttpO08601 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MttpO08601 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MttpO08601 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MttpO08601 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MttpO08601 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MttpO08601 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MttpO08601 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MttpO08601 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MttpO08601 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MttpO08601 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MttpO08601 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MttpO08601 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MttpO08601 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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