Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21310J3QQ23 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21310J3QQ23 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21310J3QQ23 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21310J3QQ23 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21310J3QQ23 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21310J3QQ23 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21310J3QQ23 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21310J3QQ23 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21310J3QQ23 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21310J3QQ23 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21310J3QQ23 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21310J3QQ23 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21310J3QQ23 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21310J3QQ23 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21310J3QQ23 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21310J3QQ23 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21310J3QQ23 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21310J3QQ23 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21310J3QQ23 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21310J3QQ23 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21310J3QQ23 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21310J3QQ23 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21310J3QQ23 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21310J3QQ23 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21310J3QQ23 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21310J3QQ23 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Gm21310J3QQ23 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21310J3QQ23 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21310J3QQ23 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21310J3QQ23 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21310J3QQ23 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21310J3QQ23 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Gm21310J3QQ23 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21310J3QQ23 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Gm21310J3QQ23 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21310J3QQ23 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Gm21310J3QQ23 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21310J3QQ23 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21310J3QQ23 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Gm21310J3QQ23 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Gm21310J3QQ23 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Gm21310J3QQ23 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm21310J3QQ23 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm21310J3QQ23 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
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Gm21310J3QQ23 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Gm21310J3QQ23 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Gm21310J3QQ23 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21310J3QQ23 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21310J3QQ23 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21310J3QQ23 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21310J3QQ23 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21310J3QQ23 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21310J3QQ23 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21310J3QQ23 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21310J3QQ23 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21310J3QQ23 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21310J3QQ23 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21310J3QQ23 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21310J3QQ23 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21310J3QQ23 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21310J3QQ23 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21310J3QQ23 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21310J3QQ23 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21310J3QQ23 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21310J3QQ23 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21310J3QQ23 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21310J3QQ23 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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