Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2056J3QQ02 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms