Protein–RNA interactions for Protein: J3QPP8

Alkal1, ALK and LTK ligand 1, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkal1J3QPP8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alkal1J3QPP8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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