Protein–RNA interactions for Protein: J3QNV7

Gm10428, Predicted gene 10428, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10428J3QNV7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Gm10428J3QNV7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Gm10428J3QNV7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Gm10428J3QNV7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gm10428J3QNV7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gm10428J3QNV7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gm10428J3QNV7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gm10428J3QNV7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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