Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms