Protein–RNA interactions for Protein: J3QM67

Gm20825, Predicted gene, 20825, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20825J3QM67 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20825J3QM67 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20825J3QM67 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20825J3QM67 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20825J3QM67 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20825J3QM67 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20825J3QM67 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20825J3QM67 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20825J3QM67 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20825J3QM67 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20825J3QM67 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20825J3QM67 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20825J3QM67 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20825J3QM67 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20825J3QM67 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20825J3QM67 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20825J3QM67 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20825J3QM67 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20825J3QM67 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20825J3QM67 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20825J3QM67 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20825J3QM67 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20825J3QM67 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20825J3QM67 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20825J3QM67 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20825J3QM67 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20825J3QM67 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20825J3QM67 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20825J3QM67 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20825J3QM67 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20825J3QM67 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20825J3QM67 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20825J3QM67 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20825J3QM67 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20825J3QM67 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20825J3QM67 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20825J3QM67 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20825J3QM67 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20825J3QM67 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm20825J3QM67 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm20825J3QM67 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm20825J3QM67 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20825J3QM67 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20825J3QM67 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20825J3QM67 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20825J3QM67 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20825J3QM67 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20825J3QM67 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20825J3QM67 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20825J3QM67 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20825J3QM67 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20825J3QM67 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20825J3QM67 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20825J3QM67 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20825J3QM67 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20825J3QM67 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20825J3QM67 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20825J3QM67 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20825J3QM67 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20825J3QM67 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20825J3QM67 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20825J3QM67 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20825J3QM67 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20825J3QM67 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20825J3QM67 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20825J3QM67 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20825J3QM67 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20825J3QM67 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20825J3QM67 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20825J3QM67 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20825J3QM67 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20825J3QM67 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20825J3QM67 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20825J3QM67 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20825J3QM67 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20825J3QM67 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20825J3QM67 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20825J3QM67 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20825J3QM67 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20825J3QM67 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20825J3QM67 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20825J3QM67 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20825J3QM67 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20825J3QM67 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20825J3QM67 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20825J3QM67 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20825J3QM67 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20825J3QM67 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20825J3QM67 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20825J3QM67 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20825J3QM67 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20825J3QM67 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20825J3QM67 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20825J3QM67 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20825J3QM67 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20825J3QM67 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20825J3QM67 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20825J3QM67 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20825J3QM67 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20825J3QM67 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms