Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubgcp6G5E8P0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubgcp6G5E8P0 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubgcp6G5E8P0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubgcp6G5E8P0 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubgcp6G5E8P0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubgcp6G5E8P0 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubgcp6G5E8P0 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubgcp6G5E8P0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubgcp6G5E8P0 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms